Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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