Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms