Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms