Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vrk3Q8K3G5 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms