Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trim68Q8K243 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trim68Q8K243 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim68Q8K243 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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