Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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FgbQ8K0E8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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FgbQ8K0E8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FgbQ8K0E8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FgbQ8K0E8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FgbQ8K0E8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FgbQ8K0E8 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FgbQ8K0E8 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FgbQ8K0E8 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FgbQ8K0E8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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FgbQ8K0E8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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FgbQ8K0E8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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FgbQ8K0E8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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FgbQ8K0E8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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FgbQ8K0E8 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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FgbQ8K0E8 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms