Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrit1Q8K099 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms