Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG19

Ltbp1, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp1Q8CG19 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ltbp1Q8CG19 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ltbp1Q8CG19 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ltbp1Q8CG19 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ltbp1Q8CG19 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ltbp1Q8CG19 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms