Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hpf1Q8CFE2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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