Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Ercc8Q8CFD5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ercc8Q8CFD5 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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