Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Usp27Q8CEG8 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Usp27Q8CEG8 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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