Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rnf170Q8CBG9 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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