Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spef2Q8C9J3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spef2Q8C9J3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms