Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccser1Q8C0C4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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