Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

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Length 725 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nhlrc2Q8BZW8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms