Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKD6

Rnf144b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144B, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144bQ8BKD6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf144bQ8BKD6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms