Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Htatsf1Q8BGC0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htatsf1Q8BGC0 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms