Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M10.4Q85ZW8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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