Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NanogQ80Z64 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms