Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Negr1Q80Z24 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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