Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms