Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Arhgef17Q80U35 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Arhgef17Q80U35 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arhgef17Q80U35 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms