Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NischQ80TM9 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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