Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1cQ7TSF0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms