Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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