Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CtifQ6PEE2 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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