Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Zbtb40Q6PCS8 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Zbtb40Q6PCS8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Zbtb40Q6PCS8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Zbtb40Q6PCS8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbtb40Q6PCS8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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