Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms