Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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