Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pkp4Q68FH0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pkp4Q68FH0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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