Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trim24Q64127 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms