Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Taf6Q62311 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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Taf6Q62311 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Taf6Q62311 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Taf6Q62311 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Taf6Q62311 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms