Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sall3Q62255 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sall3Q62255 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms