Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ecm1Q61508 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ecm1Q61508 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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