Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms