Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms