Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tsr1Q5SWD9 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tsr1Q5SWD9 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms