Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Vmn1r223Q5SSA0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r223Q5SSA0 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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