Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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