Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CenpjQ569L8 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms