Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm26706-201ENSMUST00000180718 746 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 AC156790.4-202ENSMUST00000228838 1418 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Lrrc43Q3V0L5 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Lrrc43Q3V0L5 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm5530-201ENSMUST00000117185 985 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm22906-201ENSMUST00000175191 250 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Tac1-205ENSMUST00000185187 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms