Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms