Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms