Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms