Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms