Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.6 ms