Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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