Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms