Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fndc4Q3TR08 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms