Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms